Навіть за наявності сучасної системи фільтрації басейн постійно зазнає впливу навколишнього середовища. Спори водоростей, бактерії, грибки та органічні забруднення потрапляють у воду разом із пилом, дощем, листям, комахами та потоками повітря. Повністю виключити цей процес практично неможливо.
Особливо активно мікроорганізми розвиваються в теплій воді під впливом сонячних променів. Підвищена температура створює ідеальні умови для швидкого розмноження водоростей, які починають використовувати розчинені у воді органічні речовини як джерело живлення.
Додаткове навантаження створюють самі купальники. Косметика, сонцезахисні креми, піт та інші забруднення стають живильним середовищем для бактерій і грибкових мікроорганізмів. У результаті вода поступово втрачає прозорість, з'являється неприємний наліт, а стінки басейну стають слизькими.
Якщо не проводити регулярну профілактичну обробку, колонії водоростей здатні розвиватися не лише на видимих поверхнях чаші, а й усередині трубопроводів, форсунок, фільтраційного обладнання та системи циркуляції води. Саме тому комплексний захист басейну потребує не лише дезінфекції, а й застосування спеціалізованих альгіцидів.